STIKES Bethesda Yakkum Yogyakarta adalah institusi pendidikan kesehatan yang sejak tanggal 7 April 2009 mendapatkan ijin operasional berdasarkan Surat Keputusan Menteri Pendidikan Nomor 43/D/O/2009. STIKES Bethesda Yakkum Yogyakarta mengalami perjalanan yang panjang, dari perkembangan lembaga pendidikan keperawatan Bethesda sejak tahun 1899 mendidik tenaga perawat yang disebut Sekolah Djuru Kesehatan dan Sekolah Bidan, kemudian berubah menjadi Sekolah Pengatur Rawat dan Sekolah Bidan, kemudian untuk Sekolah Bidan berubah menjadi Sekolah Perawat Bidan, perkembangan berikutnya menjadi Sekolah Perawat Kesehatan. Pada tahun 1996 konversi menjadi Akademi Keperawatan, dan sekarang berkembang menjadi Sekolah Ilmu Tinggi Kesehatan.
STIKES Bethesda Yakkum Yogyakarta telah mendapatkan akreditasi dari Departemen Kesehatan Republik Indonesia dengan strata A dengan nomor HK.00.06.2.2.3001 dan akreditasi dari Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi (BAN – PT) dengan peringkat B dengan nomor 003/BAN-PT/Ak-IX/Dpl-III/IV/2009


